在这时，修行玄门道术日益精深的他，从祭坛中读取到了一幕骇然景象。
天崩地裂，山河倒转，无数可怕异兽自一处玄异的裂缝扑出，将整个天地撕得粉碎。
籍由这景象，他找到了被先祖封住的天之痕。
也正是因为天之痕的发现，与他读取到的那灭世场景与那可怕怪兽，领导人一致认为，天之痕，极有可能就是毁灭了太平洋那处远古超级文明的真正元凶，龙坑的研究，极有可能会导致天之痕再度打开，这个危险性……太过巨大。
于是……
起源计划……彻底封停。
然而，此时的杜菁云，因为云兮年龄渐长，发现了一桩与穹天镇引有关的天大秘密，而这个秘密的重要性……甚至比人类的存亡还要重要，遗憾的是，她没能改变最终结果，于是，为了那个秘密，她决定铤而走险。
就这样，代号为天崩的事故发生了。
秋云裳的父母，就死于这场事故中。
趁乱逃出源所的杜菁云，带着云兮与藤蔓核心一份类DNA代码来到南方深山中继续她的研究。
而那份核心类DNA代码孕育出来的婴儿……
就是凌云！
这份类DNA代码的孕育方式……不同于云兮的出现方式。
他是杜菁云牺牲了自己的身体，孕育出来的。
此时，陪在她身边的，只有云兮，和另一名当初源所用类DNA孕育出来的另一个男孩，云霄。
而这时，国家终于找到了她的踪迹。
那一夜，他也来了，他用他的方式引开了新成立的龙组与所有的致命战力，杜菁云秘密安排过来的凌天河在山外接她，她将凌云交给了凌天河，带着云兮走水路离开了炎黄国，在登上孔建方安排的小船出海之前，原本就因为孕育类DNA代码而透支生命的杜菁云，再经过沿途疲命奔逃，最终，香消玉殒。
云兮与云霄，最终没有选择出海，他们将杜菁云火化了之后，按照她的遗愿，将骨灰洒入大海。
再之后，随着修习玄门术法越深，再加上李立秋体内另一个韩终人格的缘故，他终于隐约触摸到了一些当初杜菁云所了解到的真相，他知道……自己当初……错怪了菁云，悔恨的他，只想做一件事。
将真相发掘出来！还她一个公正的评价！
她，不应该被误会！
那是一个愿意牺牲自己生命，来完成那个计划的伟大英雄，而不是叛国者！
故事……结束了。
眼前看着像三十出头的男子，眸子间蕴着难以解读的复杂情感。
“或许……活得久了，对于爱情，就特别执着吧……其实，我对那个计划并不在乎，我真正在乎的是……她……”
“杜菁云……你的母亲！”
“孩子，你是她生命的延续，而不是实验室里创造出来的。她想做的，想完成的事，你……要替她走下去！而这，也
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